Le laboratoire réalise d’importantes activités en matière d’analyses microbiologiques et physico-chimiques des aliments et des eaux pour répondre à la fois aux besoins des entreprises nationales et étrangères établis sur le sol Djiboutien notamment les autocontrôle en matière de sécurité sanitaire des aliments. Ces derniers ont pour but d’améliorer la qualité des produits nationales, de garantir la qualité des produits agro-alimentaires (restaurants, hôtels, hôpitaux etc.) et enfin de surveiller la qualité des produits mis sur les marchés nationales et destinés à la consommation humaine ou animale pour protéger la santé des consommateurs. Le laboratoire est accrédité UKAF ISO/CEI 17025 -2017 qui est une norme internationale qui spécifie les « exigences générales concernant la compétence des laboratoires d'étalonnages et d'essais ».